Un nouvel été est déjà terminé, et cela signifie que les étudiants de premier cycle qui ont entrepris un stage de recherche en immunothérapie du cancer financé par BioCanRx sont également partis. Nous sommes très fiers de la façon dont ils ont appris et progressé, et nous leur adressons nos meilleurs vœux pour l'avenir !
Curieux de savoir ce que faisaient ces étudiants ? Nous avons demandé à deux d'entre eux de nous raconter leur expérience. Voici Olivia Craggs, qui a travaillé au sein du Partenariat canadien contre le cancer (PCCC) auprès de l'équipe des Premières Nations, des Inuits et des Métis et de l'équipe de prévention, et Mary Agopian, qui a travaillé au laboratoire du Dr Uri Tabori à l'Université de Toronto.
1. Qui es-tu ? Où as-tu étudié ? Quel est ton programme ? Un fait amusant à ton sujet !
Olivia: Je m'appelle Olivia Craggs et je suis une étudiante crie de la Première Nation One Arrow. J'ai grandi à Vancouver, en Colombie-Britannique, où j'étudie actuellement la biochimie. Pendant mon temps libre, j'aime la randonnée, le camping, le snowboard et le hockey !
Mary: Bonjour à tous ! Je m'appelle Mary Agopian et j'ai obtenu un baccalauréat spécialisé en microbiologie et immunologie de l'Université McGill l'an dernier. Je suis actuellement en première année de doctorat en biophysique médicale à l'Université de Toronto. Durant mes études de premier cycle, mon diplôme en microbiologie et immunologie m'a permis de découvrir un intérêt marqué pour la médecine computationnelle. Cet été, j'ai pu explorer l'application des techniques computationnelles à la recherche sur le cancer.
Un fait amusant à mon sujet est que je pratique le ballet depuis environ une décennie !
2. Pourquoi avez-vous voulu faire de la recherche sur le cancer cet été ?
Olivia: J'ai perdu de nombreuses personnes importantes à cause du cancer, dont ma mère, mon grand-père, mes professeurs et mes entraîneurs. J'étais le principal aidant de ma mère pendant ses traitements contre les cancers du col de l'utérus, du foie et de la colonne vertébrale, et de mon grand-père pendant son traitement contre un lymphome non hodgkinien. Grâce à ces expériences, j'ai acquis une meilleure compréhension des soins aux patients des Premières Nations et j'avais pour objectif de contribuer à la recherche sur le cancer.
Mary: Mon diplôme en microbiologie et immunologie m'a permis de découvrir très tôt les effets dévastateurs, systémiques et rapides du cancer. L'opportunité de combiner mes connaissances en immunologie et en bioinformatique pour contribuer à l'avancement du domaine de la résistance aux traitements dans les cancers à déficit de réparation de la réplication (RRD) était le moyen idéal de m'impliquer dans ce domaine tout en contribuant à améliorer la qualité de vie des patients.
3. Sur quoi avez-vous travaillé cet été ? Qu'avez-vous découvert ?
Olivia: J'ai collaboré avec l'équipe des Premières Nations, des Inuits et des Métis et l'équipe de prévention du Partenariat canadien contre le cancer (PCCC). Grâce à une analyse environnementale et à des entrevues avec des informateurs clés, nous avons identifié des approches de vaccination contre le VPH menées par les Premières Nations comme moyen de lutter contre le cancer du col de l'utérus. Il existe d'importantes lacunes dans les données concernant les approches menées par les Premières Nations, et la plupart des approches étaient dirigées par des Métis ou concernaient la COVID-19.
Mary: Cet été, au laboratoire Tabori, j'ai étudié les mutations génomiques qui affectent la réponse des patients aux inhibiteurs de points de contrôle immunitaire (ICI) dans les cancers à déficit de réparation de la réplication (RRD). Ces cancers sont résistants à la chimiothérapie, mais répondent aux ICI (Nature Med 2022). Cependant, 70 % des cancers à déficit de réparation de la réplication sont résistants aux ICI. Nous avons donc cherché à déterminer si des facteurs de résistance aux ICI dans le génome des patients atteints de RRD empêchent cette thérapie d'être une option thérapeutique efficace pour notre sous-population résistante.
Cette analyse a consisté à utiliser un pipeline de codage-barres de variants pour comparer les génomes des patients atteints de RRD non résistants et résistants. Nous avons ensuite utilisé un script que j'ai créé pour identifier les mutations statistiquement et biologiquement pertinentes qui différencient les deux groupes.
Cette méthode nous a permis de découvrir que 493 gènes significativement mutés différencient les patients répondant aux ICI des patients non répondants dans les cancers RRD. Ces 493 gènes comprennent des gènes biologiquement pertinents et essentiels impliqués dans la progression cancéreuse, la réponse aux dommages à l'ADN, les modifications épigénétiques et les gènes ciblables par les traitements. Ces mutations dans ces gènes spécifiques peuvent entraîner une régulation positive ou négative de voies oncogènes et immunitaires spécifiques. Par conséquent, ces mutations peuvent être utilisées pour des stratégies thérapeutiques prédictives et combinatoires en aval, ce qui ouvre la possibilité à un plus grand nombre de patients de bénéficier de traitements ICI efficaces.
4. Quel a été un moment mémorable de l’été dernier pendant votre séjour d’études ?
Olivia: Je suis extrêmement reconnaissant d'avoir eu l'occasion de participer à divers projets du CPAC. Les équipes avec lesquelles j'ai travaillé m'ont apporté un soutien exceptionnel et m'ont aidée à développer mes compétences de chercheuse. Un moment mémorable pour moi a été celui de rejoindre mon équipe à la 43e Assemblée générale annuelle de l'Assemblée des Premières Nations à Vancouver en juillet.
Mary: L'un des moments forts de mon stage d'été au laboratoire Tabori a été les réunions de laboratoire. Disposer d'un espace où les recherches innovantes sont présentées, débattues et analysées a considérablement influencé ma façon d'aborder la science.
La science est un processus collaboratif en constante évolution qui permet de progresser vers une meilleure qualité de vie. Cette expérience m'a permis de réfléchir de manière critique à la recherche et à son impact potentiel.
5. Comment cette expérience de recherche a-t-elle eu un impact sur votre développement de carrière ?
Olivia: Cette expérience avec BioCanRx et le CPAC m'a permis d'acquérir une précieuse expérience en recherche et de découvrir le domaine des politiques de santé. Elle a conforté mon objectif de carrière en sciences de la santé et m'a fait prendre conscience des importantes lacunes en matière de données sur la santé des Premières Nations.
Mary: Cette expérience de recherche m'a permis d'explorer les pipelines de codage-barres de variants bioinformatiques, les techniques de visualisation et les méthodes statistiques d'analyse des données. Acquérir davantage d'expérience en bioinformatique et en médecine computationnelle a renforcé ma passion pour ce domaine. Cette expérience a également mis en évidence l'importance de la compréhension des données, combinée à des connaissances biologiques et computationnelles, pour parvenir à des conclusions significatives dans un domaine en constante évolution, celui de la recherche sur le cancer.
6. Quel est votre espoir en matière de traitement et de soins contre le cancer à l’avenir ?
Olivia: J'espère que l'avenir des soins contre le cancer permettra de traiter toutes les formes de cancer, quel que soit le type ou le moment du diagnostic. J'espère que les traitements contre le cancer seront accessibles à tous les Canadiens, y compris ceux vivant dans les réserves rurales, et que les remèdes traditionnels pourront être intégrés aux plans de traitement.
Mary: Mon espoir pour le traitement et la prise en charge du cancer réside dans l'avancement de la recherche sur la résistance aux traitements anticancéreux et les stratégies thérapeutiques combinatoires. L'étude de la résistance aux traitements permet à un plus grand nombre de patients d'accéder à des thérapies potentielles, améliorant ainsi leur pronostic et leur qualité de vie.